如果你们签合同是按不含税价来提供材料的话,计算如下:
先计算不含税价格:总价=不含税价*(1+税率)
不含税价=409500/(1+17%)=350000元
原来17%增值税的税金为:350000*17%=59500元
现在6%增值税的税金为:350000*6%=21000元
两者相减得出:59500-21000=38500元
所以应扣除38500元

如果是要求开具的普通发票金额与增值税发票金额一致的话,就应该
先计算不含税价格:总价=不含税价*(1+税率)
不含税价=409500/(1+17%)=350000元
原来17%增值税的税金为:350000*17%=59500元
现在按6%的增值税:409500/(1+6%)*6%=23179.25元
两者相减:59500-23179.25=36320.75元 

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