根据财政部、国家税务总局《关于印花税若干政策的通知》（财税〔2006〕162号）规定，对纳税人以电子形式签订的各类应税凭证，应按规定征收印花税。因此，电子商务公司签订电子形式的合约或协议，也应缴纳印花税。