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金字塔决策模式在组织体系上分为三个层次，在金字塔的顶端即决策体系的最高层，企业战略家做为企业长期和根本利益的人格化代表，对企业的长期发展发挥前摄性作用，是企业的总设计师，负责制订企业的根本性、方向性、基础性和原则性的经营要素的决策。
决策体系的中间层，由董事会、经理人团队和顾问机构组成企业的战略管理委员会，负责把企业的战略愿景落实为战略规划，确定产业方向和总体经营思路。
决策体系的底层，由投资发展部、经营管理部、审计监察部、财务部、行政人事部负责战略的落实和风险控制，负责把战略愿景落实到具体的战略行动和投资方案，并对战略执行的效果进行过程控制，随时根据外部环境变化和战略执行的成效做出反馈和调整。
决策的各个层次之间，通过透明的信息系统、垂直管理的财务系统和审计监察系统以及互相尊重、互相信任的企业文化的建立，形成一个彼此依赖支撑的整体，构建了一个具有战略发展及风险管控型的决策总部。
该模式包括以下几个核心流程，一是卓越战略家方式，二是重点项目决策流程，三是投资决策流程，四是投资决策实施流程。
一、卓越战略家方式
各个不同的公司及其管理者战略决策的方式不尽相同，在公司内部不同层次的战略决策方式也有所区别。在卓越战略家决策中，有些管理者充当首要战略家和首要企业家的角色，对形势的评价，在探索的战略选择以及战略的细节等方面施加强大的影响。但是，这并不意味着该管理者承揽了其中的所有工作，其含义是该管理者个人成为战略的首席工程师，发挥前摄性作用，规划出战略的部分或全部层面。卓越战略家是战略司令，是既定战略的主要制定者。
二、规范、科学、严谨的重点项目决策流程
新希望集团农业股份有限公司的大部分项目的投资是由投资发展部提出的，在这个决策过程中体现了新希望集团规范、科学、严谨的项目决策流程。
三、投资决策流程
新希望集团在确定投资项目的过程中，实行严格的“三否定”原则：一否定来自板块；二否定来自领导小组，董事长有一票否决权；三否定来自股东大会。一般情况下，投资金额特别大的项目要交由股东大会进行投票决议。
投资项目立项过程总过要经由三个级别的部门单位：投资发展部——板块事业部——三级公司。
四、投资决策实施流程
新希望集团投资决策的实施很有特色，这也是保证新希望集团投资获得成功的一个重要的方面，具体有以下几个方面的特点：
1）投资决策确定后，要组建专门的实施班子进行实施。实施班子的组建非常灵活，可以从各板块调度人员。新希望集团投资华融化工的时候就面临着投资部门没有化工专家的困境，于是就在整个集团内部调用所有在化工方面懂管理，懂技术的人员，组成投资决策实施小组。
2）实施投资的过程中，为了确保工程的质量，提高效率，杜绝暗箱操作，所有的工程都要进行招标，定标的过程中由审计监察部全程监控，进行审计监察。
3）新公司建立运作以后要进行市场整合，由于新进入某个行业，生产产品的经验太少，因此要经历小试、中试，最后才到生产的过程，提高了生产的效率。
4）新投资的公司的运行管理实行对标管理。公司内部、外部的管理都推行标准成本管理，大到生产经营，小到水电。着重推行动态成本管理——即固化成本管理和标准成本管理相结合。成本绝对值依地域行业不同而不同，但所有的公司的产品都遵循固定的耗用比。
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